A differenza di altri registri (ad esempio il RASD), il RUNTS non si aggiorna automaticamente per interoperabilità con la piattaforma di tesseramento del CSI. Gli aggiornamenti e i depositi devono essere fatti tramite il portale RUNTS, aprendo la pratica corretta, come ad esempio l’istanza di variazione o il deposito del bilancio. L’ente può agire direttamente tramite il proprio legale rappresentante oppure può affidarsi alla rete associativa del CSI, ma solo se è stata conferita una delega secondo le modalità previste dal sistema. La delega può riguardare iscrizione, variazione, cancellazione, 5 per mille e deposito dei bilanci; può essere limitata alla compilazione e invio oppure estendersi anche alla sottoscrizione digitale, con una diversa ripartizione delle responsabilità.