L'omocodia è un fenomeno piuttosto raro, ma possibile, in cui due o più persone diverse ottengono lo stesso Codice Fiscale basato sui loro dati anagrafici. Questo succede quando due persone hanno nome e cognome identici o molto simili (con le stesse consonanti), sono nate nello stesso giorno e nello stesso comune; in questi casi l'algoritmo genera codici uguali. Per distinguere questi "gemelli fiscali", l'Agenzia delle Entrate modifica il codice sostituendo uno o più numeri con delle lettere, assegnando a ciascuno un codice fiscale "differenziato", diverso da quello calcolato dall'algoritmo, che quindi non esiste realmente.
In caso di omocodia, quindi, chi è coinvolto deve comunicare alla propria società il codice fiscale corretto fornito dall’Agenzia delle Entrate. La società dovrà inserirlo manualmente o richiedere l’allineamento, evitando di usare solo il codice generato automaticamente dal sistema.